Τις εύλογες αντιδράσεις των εργαζομένων του ΕΟΠΥΥ προκαλεί η απόφαση του υπουργού Υγείας Ά. Γεωργιάδη να αναθέσει την λογιστική και εγκριτική διαδικασία (ελέγχου και εκκαθάριση) του οργανισμού σε ιδιώτες.
Η νέα, ιδιωτικά διεξαγόμενη, διαδικασία ελέγχου και εκκαθάρισης, αναμένεται να αφορά κάθε σχετική συναλλαγή, είτε είναι διμερής ανάμεσα στον οργανισμό και τον εκάστοτε πάροχο, είτε πολυμερής, με τον ασφαλισμένο και το αρμόδιο λιανικό κατάστημα (π.χ. φαρμακείο ή κατάστημα ορθοπεδικών ειδών κ.ο.κ.) να μεσολαβούν στην μακρά γραμμή συναλλαγών μεταξύ ΕΟΠΥΥ και παρόχου.

Το θέμα ανέδειξαν με κοινή ανακοίνωσή τους, ο Πανελλήνιος Σύλλογος Εργαζομένων στον οργανισμό, και η Πανελλήνια Ομοσπονδία Προσωπικού Οργανισμών Κοινωνικής Πολιτικής (ΠΟΚΟΚΠ).
Οι δύο συνδικαλιστικές οργανώσεις μάλιστα, κατόπιν συλλογικών τους αποφάσεων κατέφυγαν δικαστικά κατά της ιδιωτικοποίησης αυτής. Όπως αναφέρουν στην ανακοίνωσή τους, σε πρόσφατα ένδικα βοηθήματα, τα συνδικάτα θα επικαλεστούν:
- Την αντισυνταγματικότητα του νόμου με τον οποίο προβλέπεται η εξαίρεση παρόχων και παροχών υγείας από τον δημοσίου δικαίου κλινικό και διοικητικό έλεγχο του ΕΟΠΥΥ, και η ανάθεση του ελέγχου αυτού σε Ιδιωτικούς Ελεγκτικούς Φορείς (ΙΕΦ).
- Η έλλειψη οιουδήποτε ελέγχου/εποπτείας των εργαζομένων του ΕΟΠΥΥ στη διαδικασία εκκαθάρισης της αποζημίωσης των εξαιρούμενων παρόχων και παροχών υγείας, και η απουσία αποχρώντος δικαιολογητικού λόγου που να υπαγόρευε την εκχώρηση της σχετικής αρμοδιότητας του ΕΟΠΥΥ σε ΙΕΦ, ενόψει της τεχνογνωσίας και εμπειρίας των διοικητικών υπαλλήλων και γιατρών του Οργανισμού, αλλά και ενόψει των όσων έχει ήδη κρίνει το ΣτΕ με αποφάσεις του, για την αντικειμενικότητα, την εγκυρότητα, την ακρίβεια και την αξιοπιστία, της μέχρι τώρα εφαρμοζόμενης μεθόδου δειγματοληψίας.
